Kısa Özet

TÜBİTAK 2502 Türkiye–Bulgaristan Bilimler Akademisi (BAS) ikili iş birliği çağrısına ortak başvuru yapmak üzere Bulgar bir araştırma ortağı aranmaktadır.

Önerilen proje kapsamında Türkiye ve Bulgaristan’dan izole edilen Helicobacter pylori suşlarının karşılaştırmalı moleküler epidemiyolojik analizi yapılacaktır.

Çalışmada:

• Klonal ilişkiler

• Virülans gen profilleri

• Antimikrobiyal direnç paternleri

 

incelenecek ve bakteriyel genotipler ile klinik sonuçlar arasındaki ilişkiyi ortaya koyan öngörü modelleri geliştirilecektir.

 

---

 

Proje Açıklaması

 

 

Arka Plan ve Gerekçe

 

Helicobacter pylori enfeksiyonu; kronik gastrit, peptik ülser ve mide kanseri ile güçlü şekilde ilişkili önemli bir halk sağlığı sorunudur.

 

Klinik sonuçlardaki farklılıklar;

 

• Bakteriyel virülans faktörleri

• Antimikrobiyal direnç

• Konak özellikleri

• Bölgesel epidemiyolojik farklılıklar

 

arasındaki karmaşık etkileşimlerden kaynaklanmaktadır.

 

Artan antibiyotik direnci, etkin tedaviyi zorlaştırmakta ve bu durumun anlaşılması için:

 

• Direnç paternlerinin belirlenmesi

• Klonal ilişkilerin analizi

• Virülans profillerinin incelenmesi

 

gerekmektedir.

 

Türkiye ve Bulgaristan komşu ülkeler olmasına rağmen karşılaştırmalı moleküler veri sınırlıdır. Bu proje, iki ülke arasında standartlaştırılmış veri üretimi sağlayacaktır.

 

---

 

Projenin Amacı

 

Türkiye ve Bulgaristan’daki H. pylori suşlarının:

 

• Klonal ilişkilerini

• Virülans gen profillerini

• Antimikrobiyal direnç paternlerini

 

karşılaştırmak ve klinik sonuçlarla ilişkili öngörü modelleri geliştirmek.

 

---

 

Özel Hedefler

 

1. Türkiye ve Bulgaristan’dan duyarlı ve dirençli izolatların toplanması

2. PFGE yöntemi ile klonal ilişkilerin belirlenmesi

3. cagA, vacA, babA, oipA genlerinin analizi

4. Makine öğrenmesi tabanlı modeller geliştirilmesi

5. Seçili suşlarda ileri düzey dizileme analizi yapılması

 

---

 

Yenilikçi Yönler ve Katma Değer

 

Proje kapsamında:

 

• İki ülke için kapsamlı epidemiyolojik veri üretilecek

• Klinik açıdan riskli suşlar belirlenecek

• Tedavi kararlarını destekleyen modeller geliştirilecek

• Bölgesel halk sağlığı stratejilerine katkı sağlanacak

• Uluslararası bilimsel iş birliği güçlendirilecek

 

---

 

Bulgar Ortaktan Beklenen Rol

 

Bulgar ortak:

 

• Klinik örnek toplama

• Epidemiyolojik veri sağlama

• Laboratuvar analizlerini yürütme

• Klonal analiz ve dizileme çalışmalarına katkı

• Veri analizi ve modelleme süreçlerine katılım

• Ortak yayın ve yaygınlaştırma faaliyetleri

 

---

 

Aranan Yetkinlikler

 

• Gastroenteroloji / endoskopi altyapısı

• H. pylori kültürü deneyimi

• Antibiyotik duyarlılık testleri (EUCAST/CLSI)

• PCR ve moleküler biyoloji altyapısı

• PFGE / MLST / WGS deneyimi

• Biyoinformatik ve istatistik bilgisi

• Uluslararası proje deneyimi (tercihen)

 

---

 

Ortak Türü

 

• Üniversiteler

• Araştırma merkezleri

• Bulgaristan Bilimler Akademisi’ne bağlı kurumlar

 

---

 

Çağrı Detayları

 

Program: Eureka

Çağrı: TÜBİTAK 2502 – Türkiye & Bulgaristan BAS

 

Son Başvuru Tarihleri:

 

• 31 Ocak

• 31 Mayıs

• 30 Eylül

 

Proje Süresi: 144 hafta

Tahmini Bütçe: 65.000 €